故事的起源发生在安布雷拉（保护伞）公司的生物工程实验室——“蜂巢”里，数百名遗传学、生物工程学专家正在研究一种能够改造人体的新型病毒——T病毒，公司内奸将一支半成品病毒试管人为打破，导致病毒在蜂巢内部迅速传播。

而主管蜂巢的超级计算机“红后”为了控制病毒不让其外泄到地面上，将蜂巢全部封闭，病毒很快感染了所有的职业人员。

以爱丽丝、瑞恩和马特为首的一个救援小组接到命令后来到了蜂巢，他们必须带领着特遣队员们将这种已毁灭了蜂巢所有人员的病毒隔离起来。

队员们很快发现这些职业人员们并不是真正地死去了。他们现在已成为徘徊在蜂巢内恐怖的丧尸。人类一但被他们咬伤或被抓伤就会受到感染变成丧尸。

面对着几乎无法控制的局面，几百个四处走动致命的丧尸，以及拥有强大力量的邪恶怪物“舔食者”，主角一行人经过殊死搏斗，在付出惨重的伤亡后终于逃出生天。

2. 第二部《生化危机：启示录》

T病毒在蜂巢中肆虐并很快打破了地面上的浣熊市的平静，丧尸开始在人群中出现，安布雷拉公司将整个城市封锁，规划使用摧毁城市以掩盖病毒外泄的事实。艾丽丝从“蜂巢”的僵尸群中逃离，可是她却依然逃不出生化危机的恶梦。

经过保护伞公司地下生化实验室的改造，她被赋予了超人的力量速度和感知能力。被安布雷拉注射T病毒的爱丽丝由昏睡中醒来，她在混乱的浣熊市与防卫队员瓦伦汀、记者泰莉等人组成队伍，试图找到脱身之法。

安布雷拉公司的科学家艾肯佛博士为搭救被公司抛弃在城中的女儿安琪拉，以提供逃生方式为代价请求爱丽丝和防卫人员卡洛斯两组人马帮助。

在浣熊市中爱丽丝最终被保护伞公司抓获，并被要求与由第一部中的角色“马特”改造而成的生化僵尸“暴君”决斗。而暴君残存的人性认出了爱丽丝，在其帮助下爱丽丝一行人赶在核弹爆炸前离开了浣熊市。

3. 第三部《生化危机：灭绝》

浣熊市的覆灭并没有能够控制病毒的扩散。几许星期后病毒很快扩散到了整个全球，病毒不仅吞噬了人类文明，对环境也造成了巨大的破坏。整个全球已是一片遍地丧尸的荒漠，全球毁灭只是时刻难题。

爱丽丝作为唯一能与T病毒完美融合的融合，此时已经觉醒了更强的能力，为了不被保护伞公司发行一直隐藏着行踪。在流浪中爱丽丝遇到了一个幸存者小队并一同前往北方的绿洲“洁净之地”。

而安布雷拉公司的各国总部都躲在地底之下继续着他们的研究。科研小组组长埃萨克博士研究发现爱丽斯的血液中的抗体不仅可以对抗T病毒，甚至有可能逆转病毒的效果，最后达到驯化丧尸的目的。

然而由于缺少爱丽斯的母体实验变得很困难，埃塞克博士不得以在研究基地中制造了大量爱丽丝克隆体。最后弄巧成拙自己被丧尸试验品咬伤感染病毒，变成了半人半尸的怪物。爱丽丝最终在科隆体的协助下击败了丧尸博士，并集结了大量科隆体作为自己的部队。

4. 第四部《生化危机：战神再生》

继上一集剧情，这一部的视角来到了日本东京。爱丽丝带领着她自己的克隆人军团攻入保护伞公司东京基地，终于面对了她命运中的宿敌——安布雷拉公司C.E.O.威斯克。与威斯克的对决令她失去了所有的特殊能力与部队。

爱丽丝开着双人座飞机飞去了阿拉斯加的荒芜之地，踏上了寻找全球上唯一一块儿没有被T病毒影响的世外桃源，阿卡迪亚。

爱丽丝与老战友克莱尔为了寻找答案来到了一片狼籍的洛杉矶，在这里两人找到了为数不多的幸存者并从其口中得知阿卡迪亚只是不远处海面上的一艘舰船。

众人经过苦战从丧尸中突围，抵达阿卡迪亚后却发现一切都是保护伞公司的阴谋，阿卡迪亚仍然是是保护伞公司的实验基地其中一个。失去超能力的爱丽丝与威斯克二度交手。阿卡迪亚号沉没，威克斯逃离，噩梦仍在继续。

5. 第五部《生化危机：惩罚》

在上一集中，爱丽丝和克莱尔克里斯等同伴救出了被冷冻的幸存者们，众人在离开之际却被赶来的雇佣兵赶尽杀绝。艾丽丝由于在战斗中不慎被坠机残骸打落在深海里，重新落入了保护伞公司之手。

T病毒使保护伞公司主管体系红皇后的程序发生了错误，变得残暴嗜血的她想要杀死地球上所有的生活毁灭地球。唯一能够阻止红色女王的只有最了解T病毒威力的爱丽丝一人。

试验场高耸入云，高达三百尺，顶端呈现神秘的黑色。这里不仅拥有掌控天气的神秘力量，还在一部电影的开篇中见证了东京的病毒爆发。女主身临其境地再次经历了这一惊心动魄的时刻。这座试验场被设计用于模拟各种试验，比如模拟纽约中心的病毒爆发并展示给俄罗斯人观看，进而将其技术卖给俄罗斯。模拟莫斯科的病毒爆发则展示给美国人，并将这种病毒武器化后销售。当模拟东京病毒爆发时，这项技术又卖给了中国。所有的交易背后，都隐藏着一支神秘的伞公司，他们通过售卖病毒武器来获得高额利润，这是他们最大的创造和罪恶之源。

这个秘密场所位于俄罗斯北部的堪察加海峡，早在冷战时期，前苏联在此秘密建造。冷战结束后，伞公司势力扩张，选择此处建立了这个试验场。在这里，无数生活在巨大的阴谋中消逝与重生。第一部中的角色被克隆，有的被用于试验，有的被培养成特工追杀女主。小镇家庭中的丈夫身份复杂，既是第三部的人物，也在第二部中留下身影。他与第一部中的女特工及多个克隆人有着错综复杂的联系。

至于你提到的1998年，可能是指游戏中的时刻线。游戏与电影有所不同，虽然大体故事务节相似，但游戏中的角色与电影中的女主存在区别。游戏的主角也在电影中有所呈现。在电影的第五部中，终极boss发生了变化，变成第一部中出现的人工智能“火焰女皇”。而曾经的大反派威斯克与女主携手组成统一战线反抗她。面对这样的威胁，如果不联合起来，所有人都将面临毁灭。艾达王（由李冰冰饰演）消灭了控制室所有人员，协助威斯克黑入中央控制器并关闭了安全体系两分钟，成功救出女主。游戏中也有众多角色组成接应小队去支援他们。威斯克为女主精心规划了一条逃跑路线，穿越纽约试验区并在边界等待接应小队。他们会护送女主穿过莫斯科试验区至潜艇附近，搭乘电梯逃离现场。但逃跑经过中充满挑战和牺牲，接应小队与女主经历了重重困难才最终得以安全脱离。